罕有肝功能損害。
致畸胎危險。
神經功能紊亂：在丙戊酸鈉治療期間，少數患者出現嗜睡或木僵，并導致一過性昏迷(腦病)，當治療時，可單獨出現或與癲癇發作同時出現，當劑量減少停用時，這些癥狀會減少，這些病例常發現在聯合治療特別是用苯巴比妥或突然增加丙戊酸劑量之后。
消化道紊亂(惡心、胃痛)多出現在治療開始時，但是不需停止治療，癥狀通常可在數天內消失。
短暫的和/或與劑量相關的不良反應已有報導：脫發，輕度姿勢性震顫和嗜睡。
已有報導單純纖維蛋白原減少或出血時間延長，通常不伴有臨床體征，此多發生于大劑量時(丙戊酸鈉對血小板聚集第二期有抑制作用)。
血液系統：多為血小板減少，罕有貧血，白細胞減少或全血細胞減少。
偶有報導胰腺炎，有時導致死亡。
有報告血管炎。
無肝功能異常的單純和輕度高氨血癥時有出現，但不需要停止治療。
也報告體重增加，閉經及月經紊亂。
偶有報導可逆或不可逆的聽力喪失，但其因果關系尚未明確。
丙戊酸可引起皮膚反應，如皮疹，在某些病例有毒性上皮壞死溶解，Stevens-Johnson綜合征，多形性紅斑也有報導。
有單獨報導，伴隨丙戊酸治療出現可逆性Fanconi氏綜合征，但其作用機理未明。

肝功能異常發生時情況：極個別有報導嚴重肝損害甚至死亡。最高危的病人，特別是接受多種癲癇藥治療者，有嚴重癲癇發作的嬰兒和3歲以下的兒童。尤其是那些伴有腦損害，精神遲滯和或遺傳代謝或退化性疾病者。3歲以后，發生率明顯下降，并隨年齡增長而進一步下降。在大多數病例，肝損害在治療頭六個月里出現。可疑癥狀：臨床癥狀是早期診斷的依據。特別是黃疸出現之前，出現下列癥狀應考慮到肝臟功能損害的可能，特別是那些高危病人。非特異性癥狀：通常突然出現，如乏力、厭食、嗜睡、思睡，有時伴有反復嘔吐和腹痛。癲癇復發。應告誡病人（或患兒家屬），當有上述癥狀出現時，應及時報告醫生，并立即進行臨床檢查及肝功能檢查。觀察：在治療前應進行肝功能檢查，在治療頭6個月內也應定期作肝功能監測。在一般檢查中，反映蛋白合成的試驗，特別是凝血酶原率最為相關。當確定在異常的低凝血酶原率，特別是伴有其它生化異常（纖維蛋白原和凝血因子明顯降低，膽紅素增加和轉氨酶升高）需要停止本品治療。作為預防措施，如病人同時服用水楊酸鹽也應停用，因為這些藥物的代謝途徑是相同的。在治療開始之前或手術前和自發性挫傷或出血時應查血常規，血細胞計數，包括血小板計數，出血時間和凝血時間（見不良反應）。在腎功能不全的病人，由于游離血清丙戊酸水平增高，因而需要減少本品的劑量。偶有報導應用德巴金時常出現免疫功能異常，在系統性紅班狼瘡的病人使用時，需要權衡本品的利弊。偶有胰腺炎報導。因此當服用本品病人患急性腹疼時，應查血清淀粉酶。

妊娠癲癇婦女在妊娠期間接受丙戊酸治療時伴隨出現的危險如下：伴隨癲癇和癲癇藥出現的危險在接受抗癲癇治療的母親所生下的嬰兒畸形的總發生率已證明高于一般孕婦(3％)的2-3倍，雖然有報導在多種藥物治療時，嬰兒畸形率增高。但是(與畸形有關的)治療與疾病關系尚未正式確定。最常見的畸形為唇裂和心血管畸形。突然中斷抗癲癇藥物治療可能引起母親病情加重和引起對胎兒的不利作用。伴隨本品出現的危險在動物，已證實對小鼠、大鼠及兔有致畸胎作用。在人類，接受本品治療的婦女。在懷孕期前三個月出現畸形的總危險性并不高于其它抗癲癇藥。已有復合畸形報告特別是肢體畸形的病例。那些作用的發生率尚未完全確定。本品有引起神經管缺損的傾向：脊髓腦膜膨出，脊柱裂鼓等。這些不良反應的發生率估計為1-2％。縱觀上述資料如果婦女計劃懷孕，要復習抗癲癇治療的指征，應考慮補充葉酸鹽。在妊娠期，丙戊酸抗癲癇治療如果有效則不應停止，建議單藥治療；應使用每日最小有效劑量，分次服用。應進行特殊的產前檢查監測，以檢出可能發生的神經管缺損或其它畸形新生兒危險性。有報導妊娠母親應用丙戊酸鈉，新生兒出現出血綜合征。此種出血綜合征與血纖維蛋白過少有關；已有報告低纖維蛋白血癥且可能是致命的。低纖維蛋白血癥可能伴隨凝血因子減少而出現、這種綜合征要與維生素K依賴因子減少鑒別，后者是由苯巴比妥和酶誘導劑誘導所致。哺乳期本品在母乳內分泌量是低的。大約為母親血清水平的1-10％。至今，新生兒期母乳喂養的嬰幼兒尚未發現臨床上的副作用。

丙戊酸鈉對其它藥物的作用神經阻滯劑、單胺氧化酶抑制劑、抗抑郁藥和苯并二氮卓類。本品可以增強其它精神系統藥物的作用，如上述藥。因此應進行臨床監測并按需要調整劑量。苯巴比妥：本品增加苯巴比妥的血漿濃度（由于抑制了肝臟分解代謝）導致鎮靜作用，尤其是兒童。因此，在聯合用藥的最初15天內要進行臨床監測、如出現鎮靜情況，應及時減少苯巴比妥的劑量，必要時測定血漿苯巴比妥的水平。脫氧苯比妥（撲癇酮）：本品增高血漿脫氧苯巴比妥的水平，加重其副作用（如鎮靜），當長期治療時，副作用會消失。在聯合用藥開始時，應進行臨床觀察，需要時應調整劑量。苯妥英鈉：本品增高苯妥英鈉的總血漿濃度，另外本品增加游離苯妥英鈉可能引起過量的癥狀（丙戊酸把苯妥英鈉從它的血漿蛋白結合點置換出來，同時減少了苯妥英鈉的肝臟分解代謝）。因此，應進行臨床監測，當測定血漿苯妥英鈉水平后，還應再測定游離苯妥英鈉。卡馬西平：本品與卡馬西平聯合應用時，已有報導其臨床毒性即丙戊酸可增加卡馬西平的毒性作用。在聯合用藥開始時，應進行臨床觀察，需要時應調整劑量。拉莫三嗪：丙戊酸能減少拉莫三嗪代謝，需要時應調整劑量（減少拉莫三嗪劑量）。疊氮胸苷：丙戊酸鈉可提高血漿疊氮胸苷濃度導致疊氮胸苷毒性的增加。其它藥物對本品的影響有酶誘導作用的抗癲癇藥（包括苯妥英鈉，苯巴比妥，卡馬西平），能減低血清丙戊酸濃度。當聯合治療時，應根據血藥濃度來調整劑量。FELBAMATE和丙戊酸聯合應用時，可增高血清丙戊酸濃度，丙戊酸劑量應予監測。甲氟喹增加丙戊酸代謝并有引起驚厥作用。因此，在聯合治療時可能出現癲癇發作。當本品與對蛋白結合力高的藥物（如阿斯匹林）同時應用時，血清游離丙戊酸水平可能增高。當與甲氰咪呱或紅霉素同時應用時，血清丙戊酸水平可以增高（由于肝臟代謝等降低的結果）。其它相互作用丙戊酸通常沒有酶誘導作用，因此丙戊酸不會減低使用避孕藥婦女的雌黃體酮激素的的效果。同時應用維生素K依賴性因素抗凝劑時，應嚴密監測凝血酶原率。